ovan: Civet-katter tros ha passerat SARS-CoV, viruset som orsakade SARS-utbrottet 2003, från fladdermöss till människor.
ISTOCK.COM, SPMEMORY

När ett nytt zoonotiskt utbrott inträffar, rusar forskare för att spåra arten infektionen härstammar från. Ofta hoppar infektionen från sin ursprungliga djurbärare till en mellanliggande värdart, som sedan överför viruset till människor. Identifiering av mellanliggande värdarter möjliggör riskreducerande folkhälsopolitik som ska genomföras och ger forskare en bättre förståelse för sjukdomsutvecklingen och patogenesen.

SARS-CoV-2, viruset som orsakar COVID-19, tillhör samma virusfamilj som SARS-CoV och MERS-CoV, som först cirkulerade i fladdermöss innan de överfördes via mellanliggande värdar till människor. Medan SARS-CoV-2 sannolikt kommer att ha kommit till människor genom en liknande väg, ”har vi för närvarande inga bevis för att det finns en mellanliggande värd”, säger William Karesh, vice vd för hälsa och politik vid EcoHealth Alliance, som noterar att koronavirus direkt kan överföra från fladdermöss till människor utan mellanliggande.SARS-utbrottet 2003 började med virusöverföring mellan fladdermöss och civetkatter, som sedan överförde det till människor. På samma sätt tros den mellanliggande värden under MERS-utbrottet 2012 ha varit dromedära kameler.

se ”var koronavirus kommer från”

medan COVID-19-pandemin fortsätter använder forskare modeller för att leta efter potentiella mellanliggande värdar. Från och med idag (16 mars) har det rapporterats mer än 164 000 fall och 6 507 dödsfall. De första fullständiga COVID-19-genomsekvenserna släpptes i januari 2020, vilket gjorde det möjligt för forskare att jämföra den mänskliga versionen av coronavirus med koronavirusstammar som redan isolerats hos djur.

ett nyligen publicerat papper från laboratorierna Ralph Baric och Fang Li, publicerad i Journal of Virology, använde 2003 SARS-CoV som en mall för att simulera strukturen hos viktiga COVID-19-proteiner och förutsäga i vilka andra arter virusstammen kan binda på ett sätt som liknar hur det gör hos människor.

modellerna stöder den väl accepterade tanken att interaktionen mellan den receptorbindande domänen (RBD) för coronavirus spikprotein och värdreceptorn angiotensinkonverterande enzym 2 (ACE2) kontrollerar sjukdomsöverföring i SARS och COVID-19. Med andra ord tar spikproteinet tag i ACE2 på värdceller för att få inträde i celler, där det replikerar, brister öppnar cellen och sprider sig till andra celler. Forskarna modellerade sedan ACE2-receptorproteiner som tillhör olika arter för att se vilka som är sårbara för SARS-CoV-2-infektion. Det visar sig att grisar, illrar, katter, orangutanger, apor, åtminstone vissa arter av fladdermöss och människor har liknande nivåer av affinitet för SARS-CoV-2 baserat på den strukturella likheten hos deras ACE2-receptorer.

medan laget inte utesluter civets som mellanliggande värdar för det nuvarande utbrottet noterade de flera skillnader i civet ACE2-receptorn som gjorde det mindre möjligt att binda SARS-CoV-2. Den pågående hypotesen är att det nuvarande utbrottet började i fladdermöss och sedan flyttade till en annan art. Medan många av de tidigaste fallen i Wuhan var kopplade till Huanan Seafood market—som sålde skaldjur och vilda djur, inklusive ormar och fåglar—inte alla fall har en länk till det. Det stora utbudet av djurprodukter som finns tillgängliga på marknaden och strukturella likheter mellan ACE2-receptorer i många ”misstänkta arter” betyder att forskare fortfarande inte är övertygade om överföringskedjan för SARS-CoV-2.

Även om dessa modeller skapar en kortlista över potentiella reservoararter, ”denna studie identifierar inte mellanliggande värdar”, varnar Baric. Han säger att han vill att resultaten ska hjälpa forskare att utveckla nya koronavirusdjurmodeller för att testa vacciner och droger och att studera sjukdomsprogression.

”det finns mycket pågående experimentellt arbete, vilket jag tror kommer att vara viktigt för att faktiskt bekräfta några av de hypoteser som utvecklats i detta papper”, säger Andrew Ward, en beräkningsbiolog vid Scripps Research Institute som inte var inblandad i studien.

en liknande modelleringsstudie av en annan uppsättning forskare publicerades nyligen i Journal of Medical Virology. Författarna föreslår-baserat på strukturella likheter mellan viral RBD och värd ACE2—att pangoliner, ormar och sköldpaddor kan vara möjliga mellanliggande värdar av SARS-CoV-2. Författarna noterar att ytterligare forskning behövs för att bekräfta dessa resultat, medan andra experter har diskrediterat tanken från en annan grupp forskare i Januari att ormar är SARS-CoV-2-värdar.

att bekräfta identiteten hos någon mellanliggande värd genom våtlabbexperiment är en svår process, och forskare kan aldrig nab den definitiva skyldige. ”Du kan testa tusentals fladdermöss, men för att få koronaviruset måste du fånga dem den dagen de tappar det”, säger Karesh. Han förklarar att det nu är flera månader sedan den ursprungliga SARS-CoV-2-överföringen från djur till människa inträffade, och koronaviruscirkulationen hos djur kan ha tappat bort, vilket skulle göra den ursprungliga stammen ännu svårare att hitta.

Y. Wan et al., ”Receptor recognition by novel coronavirus från Wuhan:en analys baserad på decennielånga strukturstudier av SARS,” J Virology, doi: 10.1128/JVI.00127-20, 2020.

Claire Jarvis är en Atlanta – baserad vetenskapsreporter. Maila henne på [email protected] eller hitta henne på Twitter @StAndrewsLynx.

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.